MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 30133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	AACC	9	36	1523	1558	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
2	NC_009566	AAC	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
3	NC_009566	TGT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
4	NC_009566	GTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
5	NC_009566	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
6	NC_009566	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
7	NC_009566	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
8	NC_009566	TCAA	2	8	1948	1955	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
9	NC_009566	AGTGGT	2	12	1957	1968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148825134
10	NC_009566	AATC	2	8	2071	2078	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
11	NC_009566	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
12	NC_009566	AGA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
13	NC_009566	A	7	7	2203	2209	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
14	NC_009566	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
15	NC_009566	ATC	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825134
16	NC_009566	GCA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825134
17	NC_009566	A	6	6	2360	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
18	NC_009566	TC	3	6	2450	2455	0 %	50 %	0 %	50 %	148825134
19	NC_009566	CAAAA	2	10	2492	2501	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
20	NC_009566	A	6	6	2498	2503	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
21	NC_009566	A	6	6	2639	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
22	NC_009566	A	6	6	2660	2665	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
23	NC_009566	AG	3	6	2729	2734	50 %	0 %	50 %	0 %	148825134
24	NC_009566	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
25	NC_009566	A	8	8	2852	2859	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
26	NC_009566	AAAT	2	8	2861	2868	75 %	25 %	0 %	0 %	148825134
27	NC_009566	AGGATA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825134
28	NC_009566	ATA	3	9	2900	2908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
29	NC_009566	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
30	NC_009566	ATA	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
31	NC_009566	ATG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
32	NC_009566	TGG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
33	NC_009566	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
34	NC_009566	CA	3	6	3183	3188	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
35	NC_009566	CTTA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	148825134
36	NC_009566	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
37	NC_009566	ATT	2	6	3326	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
38	NC_009566	ATTTG	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	148825134
39	NC_009566	TGA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
40	NC_009566	ATA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
41	NC_009566	ATG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
42	NC_009566	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
43	NC_009566	AAACA	2	10	3511	3520	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
44	NC_009566	A	6	6	3520	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	148825134
45	NC_009566	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
46	NC_009566	TACAT	2	10	3720	3729	40 %	40 %	0 %	20 %	148825134
47	NC_009566	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
48	NC_009566	TA	3	6	3797	3802	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
49	NC_009566	TTAG	2	8	3823	3830	25 %	50 %	25 %	0 %	148825134
50	NC_009566	GTA	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
51	NC_009566	AATT	2	8	3903	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
52	NC_009566	ATGG	2	8	3943	3950	25 %	25 %	50 %	0 %	148825134
53	NC_009566	AATG	2	8	4008	4015	50 %	25 %	25 %	0 %	148825134
54	NC_009566	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
55	NC_009566	ACC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
56	NC_009566	AGA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
57	NC_009566	TA	3	6	4253	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
58	NC_009566	AACA	2	8	4334	4341	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
59	NC_009566	TCAGT	2	10	4393	4402	20 %	40 %	20 %	20 %	148825134
60	NC_009566	A	7	7	6958	6964	100 %	0 %	0 %	0 %	148825135
61	NC_009566	CGT	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
62	NC_009566	CAAA	2	8	7104	7111	75 %	0 %	0 %	25 %	148825135
63	NC_009566	GTA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
64	NC_009566	A	6	6	7208	7213	100 %	0 %	0 %	0 %	148825135
65	NC_009566	TG	3	6	7231	7236	0 %	50 %	50 %	0 %	148825135
66	NC_009566	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
67	NC_009566	TG	3	6	7294	7299	0 %	50 %	50 %	0 %	148825135
68	NC_009566	AAG	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
69	NC_009566	ATGC	2	8	7372	7379	25 %	25 %	25 %	25 %	148825135
70	NC_009566	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
71	NC_009566	AAG	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
72	NC_009566	GCA	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
73	NC_009566	TGA	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
74	NC_009566	ATT	2	6	7544	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
75	NC_009566	CTT	2	6	7553	7558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825135
76	NC_009566	CA	3	6	7559	7564	50 %	0 %	0 %	50 %	148825135
77	NC_009566	TTTC	2	8	7612	7619	0 %	75 %	0 %	25 %	148825135
78	NC_009566	TGC	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
79	NC_009566	TTA	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
80	NC_009566	CTG	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
81	NC_009566	GAA	2	6	7993	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
82	NC_009566	AAC	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825135
83	NC_009566	AAAT	2	8	8018	8025	75 %	25 %	0 %	0 %	148825135
84	NC_009566	CAG	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
85	NC_009566	TCA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825135
86	NC_009566	TTTGAT	2	12	8161	8172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825135
87	NC_009566	TTAC	2	8	8182	8189	25 %	50 %	0 %	25 %	148825135
88	NC_009566	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
89	NC_009566	TTAA	2	8	8232	8239	50 %	50 %	0 %	0 %	148825135
90	NC_009566	ATG	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
91	NC_009566	CAA	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825136
92	NC_009566	TAT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825136
93	NC_009566	A	6	6	8556	8561	100 %	0 %	0 %	0 %	148825136
94	NC_009566	GTA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
95	NC_009566	AGA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
96	NC_009566	TGG	2	6	8843	8848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
97	NC_009566	ATA	2	6	8849	8854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
98	NC_009566	GAA	2	6	8994	8999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
99	NC_009566	A	6	6	8998	9003	100 %	0 %	0 %	0 %	148825136
100	NC_009566	TGA	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
101	NC_009566	AAG	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
102	NC_009566	TCTA	2	8	9083	9090	25 %	50 %	0 %	25 %	148825136
103	NC_009566	CA	3	6	9101	9106	50 %	0 %	0 %	50 %	148825136
104	NC_009566	TCAC	2	8	9126	9133	25 %	25 %	0 %	50 %	148825136
105	NC_009566	ATA	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
106	NC_009566	GTG	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
107	NC_009566	ATG	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
108	NC_009566	A	6	6	9337	9342	100 %	0 %	0 %	0 %	148825136
109	NC_009566	A	6	6	9351	9356	100 %	0 %	0 %	0 %	148825136
110	NC_009566	GAT	2	6	9472	9477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
111	NC_009566	GCA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
112	NC_009566	TGGC	2	8	9548	9555	0 %	25 %	50 %	25 %	148825136
113	NC_009566	GGT	2	6	9592	9597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
114	NC_009566	TAAA	2	8	9629	9636	75 %	25 %	0 %	0 %	148825136
115	NC_009566	GCA	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
116	NC_009566	GTT	2	6	9694	9699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825136
117	NC_009566	TGAT	2	8	9830	9837	25 %	50 %	25 %	0 %	148825136
118	NC_009566	AACCA	2	10	9861	9870	60 %	0 %	0 %	40 %	148825136
119	NC_009566	GCG	2	6	10204	10209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825136
120	NC_009566	ATA	2	6	10299	10304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
121	NC_009566	TCA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825137
122	NC_009566	TAT	2	6	10576	10581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825137
123	NC_009566	C	12	12	10582	10593	0 %	0 %	0 %	100 %	148825137
124	NC_009566	TAA	2	6	10610	10615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
125	NC_009566	ATAA	2	8	10658	10665	75 %	25 %	0 %	0 %	148825137
126	NC_009566	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
127	NC_009566	CTTTT	2	10	10726	10735	0 %	80 %	0 %	20 %	148825137
128	NC_009566	T	6	6	10751	10756	0 %	100 %	0 %	0 %	148825137
129	NC_009566	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825137
130	NC_009566	TCC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148825137
131	NC_009566	ATA	2	6	10980	10985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
132	NC_009566	GATA	2	8	11492	11499	50 %	25 %	25 %	0 %	148825138
133	NC_009566	ATG	2	6	11518	11523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825138
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135	NC_009566	TTA	2	6	11598	11603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825138
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